До складу КВЕП "Подільськводоканал" входять наступні підрозділи:

- цех  експлуатації систем централізованого водопостачання;

- цех експлуатації систем централізованого водовідведення;

- енергетична служба;

- транспортний цех;

- абонентський відділ;

- інженерно-технічний персонал;

- адміністративно-управлінський апарат.